Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms