Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms