Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms