Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E1P51965 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E1P51965 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms