Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FNTBP49356 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FNTBP49356 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNTBP49356 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNTBP49356 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms