Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A3P48751 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms