Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR4P46093 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPR4P46093 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPR4P46093 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms