Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHKA1P46020 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms