Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MLH1P40692 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MLH1P40692 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms