Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms