Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RYKP34925 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RYKP34925 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RYKP34925 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RYKP34925 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RYKP34925 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms