Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRS3P32247 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms