Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms