Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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