Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALDH4A1P30038 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms