Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB2P29033 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB2P29033 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB2P29033 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB2P29033 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB2P29033 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB2P29033 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms