Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABCD3P28288 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms