Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB5P28074 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms