Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms