Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DNMT1P26358 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms