Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms