Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD247P20963 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD247P20963 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD247P20963 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms