Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNA1P20827 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms