Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXA5P20719 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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