Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DESP17661 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DESP17661 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DESP17661 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DESP17661 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DESP17661 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms