Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB3P16520 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB3P16520 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms