Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTHFD2P13995 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms