Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms