Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms