Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD2P0DJD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms