Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms