Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFNA4P05014 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms