Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGAP02671 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGAP02671 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FGAP02671 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGAP02671 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGAP02671 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGAP02671 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGAP02671 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGAP02671 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGAP02671 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGAP02671 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGAP02671 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms