Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EGFRP00533 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EGFRP00533 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EGFRP00533 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms