Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD4O95243 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD4O95243 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD4O95243 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD4O95243 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD4O95243 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms