Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL18O94889 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms