Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM4AO75164 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms