Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAK2O60296 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms