Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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