Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DENRO43583 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DENRO43583 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DENRO43583 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DENRO43583 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DENRO43583 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms