Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ3O43525 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms