Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HTRA2O43464 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms