Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COCHO43405 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COCHO43405 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COCHO43405 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COCHO43405 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COCHO43405 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COCHO43405 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COCHO43405 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms