Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD7O15105 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD7O15105 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms