Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQV1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQV1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BQV1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BQV1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BQV1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BQV1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BQV1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQV1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQV1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQV1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms