Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYSRT1A8MQ03 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms