Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX3A6NHT5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms