Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC160A6NGH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC160A6NGH7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms