Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF316A6NFI3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms