Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf170A2RU37 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms